Можно использовать, например, requirejs + sass (+sass-import-once). Require и sass можно, я думаю, заменить на другие сборщик и препроцессор. Плюсы - оно многим знакомо и популярно. Минусы - зависимости придется указывать и в js и в css. (хотя мы их все равно указываем в ym, так что это за минус можно не считать)

Если я правильно понял вопрос, конечно.

@apsavin Да, вопрос именно об этом. Спасибо!