А что хочется получить? BEMDOM.append(ctx, $('.my-block').clone()) должно работать.

@tadatuta хочется скопировать блок со всеми свойствами, с dom элементом в другой блок.

вариант, который я предложил, не решает задачу?

@tadatuta думаю человек имел ввиду аналог в формате bemDom.clone(this) - чтобы после клонирования, можно было воспользоваться всеми методами и возможностями БЕМ для нового экземпляра, в контексте его нового месторасположения в структуре DOM (если к примеру его требуется куда-то переместить)