Проблема в bemhtml шабоне(ах) скорее всего. Он уходит в рекурсию и не возвращается. В каком конкретно - лень искать. Смотрите что у вас с applyCtx конструкциями.

В template.blocks/header/header.bemhtml — он пытается переписать себя на самого себя.

@tadatuta т.е. по идее надо заменить это

block('header')(
    tag()('header'),
    def()(function(){
        return applyCtx([
            {
                block: 'header',
                content: [...]
            }
        ])
    })
)

на это

block('header')(
    tag()('header'),
    replace().once()(function(){
        return [
            {
                block: 'header',
                content: [...]
            }
        ]
    })
)

1. Нашел в доках про replace(). А где можно почитать про once() ( из названия понятно, что должно отрабатывать только раз.)?
2. И я, похоже, не понимаю, как работает bemhtml. На вход приходит bemjson -> bemhtml проверяет все условия и в зависимости от тела шаблона выдает требуемый bemjson. Как получается, что шаблон снова вызывает себя и зацикливается при моей предыдущей реализации?

Заменил на replace().once()(), но теперь выскакивает другая ошибка при сборке (скрин консоли http://prntscr.com/bpd7pg). Ругается на @extend ".link", пока не могу понять из-за чего. если необходим репозиторий - https://github.com/karalkou/project/tree/from-home (ветвь from-home)

похоже, что css сборка не справилась со stylus