а ваш модуль кто-нибудь реквайрит? если провайдить ничего не собираешься, замени на:

modules.require([ 'jquery', 'jslib__underscore', 'jslib__eventable', 'jslib__sir-trevor' ], function($, _, Eventable, SirTrevor) {
    new SirTrevor.Editor();
    console.log(Eventable);
    console.log(_);
    console.log(SirTrevor);
    console.log(123);
});

Если нужен именно модуль, то надо чтобы он был указан где-то в зависимостях.

Еще хочу заметить, что sir-trevor, кажется, хочет underscore для себя, и его обязательно подключать при define самого sir-trevor, но его, как и eventable, не обязательно подключать здесь. ;-)

где и что прописать? сейчас

modules.define('jslib__sir-trevor', function(provide) {
    /*borschik:include:../../desktop.blocks/jslib/__sir-trevor/sir-trevor.js*/
provide(SirTrevor);

});
modules.define('jslib__underscore', function(provide) {
    /*borschik:include:../../desktop.blocks/jslib/__underscore/underscore.js*/
    provide(_);
});
modules.define('jslib__eventable', function(provide) {
    /*borschik:include:../../desktop.blocks/jslib/__eventable/eventable.js*/
    provide(Eventable);
});

для начала, лучше исходные файлы загружать в проект с помощью bower и инклюдить борщиком из его каталога. нет необходимости руками класть файлы в структуру блоков

bower install sir-trevor-js

// загружаем jquery из модульной системы
modules.define('trevor', ['jquery'], function(provide, jquery){
  // кладём его в переменную window, потому что именно в ней SirTrevor пытается найти jquery
  var window = {
    $ : jquery
  }
  /* borschik:include:../../libs/sir-trevor-js/sir-trevor.js */
  // если SirTrevor не найдёт модульной системы amd, он разместит себя в window, который мы ему любезно подсунули.
  provide(window.SirTrevor);
});

А как необходимые модули(Eventable, underscore) добавить, от которых зависит работа sir trevor?

и как потом привязать к этому

<form> <textarea class="js-st-instance"></textarea> </form>

<script> new SirTrevor.Editor({ el: $('.js-st-instance') }); </script>

modules.require(['trevor', 'jquery'], function(SirTrevor, $){
  new SirTrevor.Editor({ el: $('.js-st-instance') });
});

А как необходимые модули(Eventable, underscore) добавить, от которых зависит работа sir trevor?

Никак. Все необходимые Тревору зависимости присутствуют в собранном файле, который мы инклюдим борщиком:

• Eventable
• Lo-Dash
• и прочие

Кстати заголовок топика абсолютно не связан с вопросом. Фреймворк i-bem.js здесь абсолютно непричём. Всё что мы обсудили касается только модульной системы ymodules и способа загрузки в неё стороннего модуля с помощью борщика без модификации исходников.

Если вам не нужна модульная система или просто не хочется писать обёртки над скриптами, то вы можете использовать сторонние скрипты по старинке (огребая проблемы совместимости по пути по мере усложнения проекта), не используя ymodules вовсе:

// jquery должен быть в глобальном window
/* borschik:include:../../libs/sir-trevor-js/sir-trevor.js */

<form> <textarea class="js-st-instance"></textarea> </form>

<script> new SirTrevor.Editor({ el: $('.js-st-instance') }); </script>